אגף התקשוב, אשר הוקם בשנת 2003, אמון על הפעלת הכוח, וכן גיבוש ומימוש מדיניות התקשוב בצה"ל. בין היתר, אחראי האגף על ניהול ההגנה בסייבר, בניית הכוח והפעלתו. כמו כן הוא מפעיל את חיל הקשר ומספר יחידות מסווגות.
האגף הוקם לאחר עבודת מטה שנעשתה על ידי מפקד הגיס הצפוני דאז, רא"ל (מיל') בני גנץ.
עד להקמת אגף התקשוב, סמכויות חיל הקשר היו בעיקר תחת אגף המבצעים במטכ"ל. עם ההתפתחות וגדילת המורכבות של המערך התקשובי והטכנולוגיה בצה"ל, נולד הצורך בריכוז מאמצי התכנון והנחיות הפעילות.
הקמתו של אגף במטה הכללי שייעודו עיסוק בנושא התקשוב, הייתה ביטוי לדגש ששם צה"ל על מחשוב, תקשורת נתונים ושליטה ובקרה. התקשוב נמצא בליבת העשייה הצבאית בתחומי התוכנה, הקשר והטכנולוגיה.
פעילותו הנרחבת של האגף בולטת בשני העשורים האחרונים, נוכח כניסת הטכנולוגיה והמחשוב בצורה נרחבת לפעילות הצבאית.
האגף הוא הצעיר מבין אגפי המטכ"ל ואנשיו פועלים לשמור על עליונות טכנולוגית. האגף מורכב מחיל הקשר והתקשוב, יחידת לוטם וחטיבת ההגנה בסייבר.
לאור השינוי הדיגיטלי שחל בצה"ל והצורך לשמר על עליונות טכנולוגית בממד ללחימה זה, וכחלק מתהליך רה ארגון הסייבר בצה"ל, קיבל האגף לאחריותו את ההובלה על הלוחמה במימד הדיגיטלי ומאז שנת 2017 הוכר כאחד מעשרת מפעילי הכוח של צה"ל - האמון על הובלה המערכה המבצעית בממד הדיגיטלי.
