השם אט"ל מייצג את האגף כגוף לוגיסטי טכנולוגי בעל אחריות כוללת לתחום הלוגיסטיקה בצה"ל. במהלך שנת 2008 האגף החליף חזרה את השם אלר"ם (אגף הלוגיסטיקה, הרפואה והמרכזים) לשמו הקודם אט"ל, מתוך הבנה שהשם הותיק והמוכר מבטא במידה רבה את מיצובו הנכון של האגף בהיבט הטכנולוגי.

השם אט"ל מבטא את הזיקה ואת הקשר לחילות הלוגיסטיים כולם, כמו גם לשלמות כאגף וכפיקוד שעניינו הוא לוגיסטיקה וטכנולוגיה. גם האות ט', המייצגת טכנולוגיה, שואבת את מקומה הרלוונטי מתוך הגדרת מילון מונחי צה"ל: "ידע מאורגן לייצור מוצרים, לתפעולם ולאחזקתם", הגדרה התואמת במדויק את פעילותו של הארגון לצד מושג הלוגיסטיקה.