יחידת אגוז הוקמה בשנת 1995 ונקראה על שמה של סיירת "אגוז" המיתולוגית. היחידה הוקמה על מנת להביא למהפך ביכולות צה"ל מול ארגון הטרור "חיזבאללה", ועד היום היא מתמחה בלוחמת גרילה - בעיקר לאורך גבולה הצפוני של המדינה. מהות אגוז גם באה לידי ביטוי דרך הסיסמת היחידה: "ארדוף אויביי ואשיגם ולא אשוב עד כלותם".
"אגוז" מתמחה בלחימה בשטח סבוך, בשדאות, הסוואה וכן בלוחמה זעירה - לחימת טווח קצר שבה איכותו ומקצועיותו של הלוחם מהוות את המרכיב העיקרי להצלחתה. היחידה פועלת בכל זמן, בכל זירה ובכל גזרה תוך התמקדות בגזרת הצפון.
ליחידה גם פלגת אמל"ח ייחודית - פלגת הפיתוח של היחידה, האחראית למצוא פתרונות יצירתיים וחידושים טכנולוגים לבעיות שצצות בשטח, ומתן הגנה נגד דרכי פגיעה חדשות שמסגל האויב.